28 апреля 2012 года в Ногинский городской суд Московской области поступило уголовное дело по обвинению Алексея Шаркова в совершении преступления, предусмотренного ст. 286 ч. 1 УК РФ. Шарков обвиняется в том, что совершил превышение должностных полномочий, то есть, являясь должностным лицом, совершил действия, явно выходящие за пределы его полномочий и повлекшие существенное нарушение прав и законных интересов гражданина и охраняемых законом интересов государства), при следующих обстоятельствах:

Будучи назначенным распоряжением Главы муниципального образования «Город Ногинск Московской области» от 30 декабря 2011 года на должность первого заместителя Главы администрации вышеуказанного муниципального образования с 01 января 2012 года, и, осуществляя организационно-распорядительные и административно-хозяйственные функции в органе местного самоуправления, незаконно требовал от Минаевой О.Д. за решение вопроса о выдаче разрешения на ввод здания в эксплуатацию, денежные средства в сумме 1500000 рублей в качестве финансирования ремонтно-строительных работ по благоустройству муниципальных объектов г. Ногинска Московской области, чем существенного нарушил права и законные интересы Минаевой О., выразившихся в нарушении права гражданина на свободное использование имущества (денежных средств) для предпринимательской и иной экономической деятельности, гарантированного ст. 34 Конституции РФ, а также охраняемые законом интересы государства, что выразилось в подрыве авторитета муниципальной службы и муниципального образования «город Ногинск Московской области» как органа местного самоуправления, призванного гарантировать и обеспечивать права и законные интересы граждан и организаций, обеспечивать их защиту от злоупотреблений органов государственной власти согласно общепризнанным нормам и принципам международного права.

Обвиняемым после консультации со своим адвокатом было заявлено ходатайство о применении особого порядка судебного разбирательства, который предусматривает более быстрый порядок рассмотрения уголовного дела, без допроса потерпевших и свидетелей.